يمكن أن يحدث نقص في مستوى فيتامين د عن طريق عدة أسباب وهذه أهمها:

• عدم الحصول على كميات كافية من فيتامين د من مصادره الطبيعية وعادة ما يحدث ذلك، إذا كنت تتبع نظاماً غذائيا نباتياً صارماً، لأن معظم المصادر الطبيعية لفيتامين د هي مصادر حيوانية، بما في ذلك: السمك، زيوت الأسماك، صفار البيض، الجبن، اللبن المعزز، وكبد الأبقار. التعرض الغير كافي لأشعة الشمس المباشرة، حيث يقوم الجسم بإنتاج فيتامين د بشكله الفعال عندما يتعرض الجلد لأشعة الشمس.
• مشاكل عضوية في الجسم مثل:
  • سوء الامتصاص: قد تؤثر بعض اضطرابات الجهاز الهضمي على عملية امتصاص فيتامين د، مثل مرض كرون، التليف الكيسي، والداء الزلاقي أو السيلياك.قد تؤثر بعض اضطرابات الجهاز الهضمي على عملية امتصاص فيتامين د، مثل مرض كرون، التليف الكيسي، والداء الزلاقي أو السيلياك.
  • مشاكل الكلى : تقوم الكلى بتحويل فيتامين د إلى شكله النشط، لذا قد يسبب أي خلل في وظائف الكلى نقصا في مستويات الفيتامين.

    أسباب أخرى:

  • فيتامين د يتأثر ببعض العقاقير الدوائية.
  • نقص تركيز الفيتامين في حليب الأم للطفل الرضيع.
  • فرط السُمنة حيث يتم تخزين الفيتامين في الانسجة الدهنية.
  • البشرة الداكنة: يعمل صبغة الميلانين على تقليل قدرة الجلد على إنتاج فيتامين د استجابة للتعرض لأشعة الشمس، لذا عادة ما ينصح بالتعرض لأشعة الشمس لفترات أطول.